Modifikovaný škrob je práškový materiál, takže jeho náchylnost k aglomeraci během zpracování závisí do značné míry na stavu materiálu a skutečné provozní metodě. Při správném skladování a přiměřeném rozptýlení může modifikovaný škrob obecně udržovat dobrý stav prášku. Avšak vystavení vlhkosti, koncentrované podávání nebo nedostatečné míchání během zpracování může způsobit místní shlukování a tvorbu hrudek.
Absorpce vlhkosti je jedním ze společných faktorů, které mohou přispívat k aglomeraci. Když se prášek modifikovaného škrobu dostane do kontaktu s vodou, částice mohou rychle absorbovat vlhkost a způsobit jejich vzájemné přilnutí. Pokud se kolem vlhkých částic nadále hromadí velké množství suchého prášku, mohou se tvořit hrudky. Jakmile se takové hrudky vyvinou, mohou vyžadovat další dobu míchání, aby se správně dispergovaly.
Způsob krmení může také významně ovlivnit aglomeraci. Pokud se přidá velké množství modifikovaného škrobu najednou, prášek se může koncentrovat v určité oblasti materiálu. Když se místní koncentrace rychle zvyšuje a dostupná vlhkost nebo mísící účinek je nedostatečný, částice mohou k sobě přilnout. Proto by v praktických operacích neměla být velká množství prášku obecně nasypána na stejné místo najednou. Místo toho by měl být materiál přidáván postupně podle podmínek zpracování.

Účinnost míchání je dalším důležitým faktorem. Pokud není modifikovaný škrob po přidání rychle a rovnoměrně promíchán, prášek může zůstat koncentrovaný v určitých oblastech a postupně tvořit agregáty. To může být zvláště patrné u vysoce viskózních materiálů, kde je celkový pohyb materiálu relativně pomalý a prášek se obtížněji rozptyluje. Proto by mělo být udržováno vhodné míchání podle materiálových charakteristik, aby mohl být modifikovaný škrob distribuován v systému co nejúčinněji.
Podmínky skladování modifikovaného škrobu před použitím mohou také ovlivnit jeho chování během zpracování. Pokud materiál již absorboval vlhkost nebo vytvořil zjevné hrudky před použitím, může být obtížnější jej rozptýlit, i když jsou podmínky následného zpracování náležitě kontrolovány. Proto je důležitá kontrola stavu prášku před použitím. Pokud jsou zjištěny zjevné abnormality, měl by být materiál před zavedením do zpracovatelského systému vyhodnocen.
Ke snížení rizika aglomerace během zpracování lze přijmout několik opatření. Za prvé, modifikovaný škrob by měl být udržován co nejsušší a během používání by mělo být minimalizováno zbytečné vystavení vzduchu a vlhkosti. Za druhé, měla by být přijata vhodná metoda krmení, aby se zabránilo přidávání velkého množství prášku v krátké době. Za třetí, po přidání by mělo být zajištěno dostatečné promíchání, aby se zajistilo, že modifikovaný škrob bude rovnoměrně distribuován v celém materiálovém systému.
Pokud během zpracování dojde k aglomeraci, měla by být nejprve zjištěna příčina. Pokud je problém způsoben především příliš rychlým krmením, může pomoci úprava způsobu krmení a zlepšení rozptylu. Pokud problém souvisí s vlhkostí materiálu nebo nedostatečným promícháním, měl by být celkový postup zpracování odpovídajícím způsobem upraven. Pouhé prodloužení doby míchání není vždy dostatečné, protože různé příčiny aglomerace vyžadují různá řešení.
Modifikovaný škrob proto není nutně náchylný k aglomeraci během zpracování. Když je materiál správně skladován a procesy dávkování, rozptylování a míchání jsou vhodně řízeny, lze výskyt hrudek výrazně snížit, což pomáhá modifikovanému škrobu udržovat dobré zpracovatelské vlastnosti a dosáhnout lepší aplikační výkonnosti.

